Διαφορά μεταξύ Alpha Helix και Beta πτυχωμένου φύλλου | Alpha Helix και Beta Pleated Sheet

Διαφορά κλειδιού - Alpha Helix vs Beta πτυχωμένο φύλλο

Οι έλικες άλφα και τα πτυχωτά φύλλα βήτα είναι οι δύο πιο συχνά συναντώμενες δευτερογενείς δομές σε πολυπεπτιδική αλυσίδα. Αυτά τα δύο δομικά στοιχεία είναι τα πρώτα κύρια βήματα στη διαδικασία της αναδίπλωσης μιας πολυπεπτιδικής αλυσίδας. Η διαφορά κλειδιού μεταξύ του Alpha Helix και του Beta Pleated Sheet βρίσκεται στη δομή τους . έχουν δύο διαφορετικά σχήματα για να κάνουν μια συγκεκριμένη δουλειά.

Τι είναι το Alpha Helix;

Μια άλφα έλικα είναι ένα σωληνοειδές πηνίο υπολειμμάτων αμινοξέων σε πολυπεπτιδική αλυσίδα. Το εύρος υπολειμμάτων αμινοξέων μπορεί να κυμαίνεται από 4 έως 40 υπολείμματα. Οι δεσμοί υδρογόνου που σχηματίζονται μεταξύ του οξυγόνου της ομάδας Ο = Ο στο άνω πηνίο και το υδρογόνο της ομάδας Ν-Η του πηνίου πυθμένα βοηθούν να συγκρατηθεί το πηνίο μαζί. Ένας δεσμός υδρογόνου σχηματίζεται ανά τέσσερα υπολείμματα αμινοξέων στην αλυσίδα με τον ανωτέρω τρόπο. Αυτό το ομοιόμορφο σχέδιο δίνει συγκεκριμένα χαρακτηριστικά όπως το πάχος του πηνίου και υπαγορεύει το μήκος κάθε πλήρους στροφής κατά μήκος του άξονα έλικας. Η σταθερότητα της δομής άλφα έλικας εξαρτάται από διάφορους παράγοντες.

Άτομα Ο σε κόκκινο, άτομα Ν σε μπλε και δεσμοί υδρογόνου ως πράσινες διακεκομμένες γραμμές

Τι είναι το πτυχωμένο φύλλο Beta;

Το πτυχωτό φύλλο βήτα, επίσης γνωστό ως φύλλο βήτα, θεωρείται ως η δεύτερη μορφή δευτερογενούς δομής στις πρωτεΐνες. Περιέχει βήτα που συνδέονται πλευρικά με τουλάχιστον δύο ή τρεις δεσμούς υδρογόνου σκελετού για να σχηματίσουν ένα στριμμένο, πτυχωτό φύλλο όπως φαίνεται στην εικόνα. Ένας βήτα κλώνος είναι μια έκταση πολυπεπτιδικής αλυσίδας. το μήκος της είναι γενικά ίσο με 3 έως 10 αμινοξέα, συμπεριλαμβανομένης της ραχοκοκαλιάς σε εκτεταμένη επιβεβαίωση.

τετράπλευρο αντιπαράλληλο θραύσμα φύλλου β από κρυσταλλική δομή του ενζύμου καταλάση.

α) δείχνοντας τους αντιπαράλληλους δεσμούς υδρογόνου (διακεκομμένοι) μεταξύ πεπτιδικών ομάδων ΝΗ και ΟΟ σε γειτονικούς κλώνους. Τα βέλη δείχνουν την κατεύθυνση αλυσίδας και τα περιγράμματα πυκνότητας ηλεκτρονίων περιγράφουν τα άτομα που δεν είναι Η. Τα άτομα Ο είναι κόκκινες μπάλες, τα άτομα Ν είναι μπλε και τα άτομα Η παραλείπονται για απλότητα. οι πλευρικές αλυσίδες εμφανίζονται μόνο στο πρώτο άτομο C πλευρικής αλυσίδας (πράσινο)

β) Οπίσθια όψη των κεντρικών δύο β αλυσίδων

Σε βήτα πτυχωτά φύλλα, οι πολυπεπτιδικές αλυσίδες κινούνται το ένα δίπλα στο άλλο. Παίρνει το όνομα "πτυχωτό φύλλο" λόγω της κυματοειδούς εμφάνισης της δομής. Συνδέονται μεταξύ τους με δεσμούς υδρογόνου.Αυτή η δομή επιτρέπει τον σχηματισμό περισσότερων δεσμών υδρογόνου με έκταση της πολυπεπτιδικής αλυσίδας.

Ποια είναι η διαφορά μεταξύ του Alpha Helix και του Beta Pleated Sheet;

Δομή του Alpha Helix και του Beta Pliable Sheet

Alpha Helix:

Σε αυτή τη δομή, ο σκελετός του πολυπεπτιδίου συνδέεται στενά γύρω από έναν φανταστικό άξονα ως μια σπειροειδή δομή. Είναι επίσης γνωστή ως η ελικοειδής διάταξη της πεπτιδικής αλυσίδας.

Ο σχηματισμός δομής άλφα έλικας συμβαίνει όταν οι πολυπεπτιδικές αλυσίδες στρίβονται σε μια σπείρα. Αυτό επιτρέπει σε όλα τα αμινοξέα στην αλυσίδα να σχηματίζουν δεσμούς υδρογόνου (μια σύνδεση μεταξύ ενός μορίου οξυγόνου και ενός μορίου υδρογόνου) μεταξύ τους. Οι δεσμοί υδρογόνου επιτρέπουν στην έλικα να συγκρατεί το σπειροειδές σχήμα και δίνει σφιχτό πηνίο. Αυτό το σπειροειδές σχήμα κάνει την άλφα έλικα πολύ ισχυρή.

Οι δεσμοί υδρογόνου υποδεικνύονται από τις κίτρινες κουκίδες.

Beta Πλεγμένο φύλλο:

Όταν δύο ή περισσότερα θραύσματα πολυπεπτιδικών αλυσίδων αλληλεπικαλύπτονται μεταξύ τους σχηματίζοντας μια σειρά δεσμών υδρογόνου μεταξύ τους, μπορούν να βρεθούν οι ακόλουθες δομές. Μπορεί να συμβεί με δύο τρόπους. παράλληλη διάταξη και αντιπαράλληλη διάταξη.

Παραδείγματα δομής:

Alpha Helix: Τα νύχια ή τα νύχια μπορούν να ληφθούν ως παράδειγμα δομής άλφα έλικας.

Beta πτυχωμένο φύλλο: Η δομή των φτερών είναι παρόμοια με τη δομή του βήτα πτυχωμένου φύλλου.

Χαρακτηριστικά της δομής:

Alpha Helix: Σε δομή άλφα έλικας, υπάρχουν 3,6 αμινοξέα ανά στροφή της έλικας. Όλοι οι πεπτιδικοί δεσμοί είναι trans και επίπεδες και οι ομάδες Ν-Η στους πεπτιδικούς δεσμούς δείχνουν προς την ίδια κατεύθυνση, η οποία είναι περίπου παράλληλη με τον άξονα της έλικας. Οι ομάδες C = O όλων των πεπτιδικών δεσμών δείχνουν προς την αντίθετη κατεύθυνση και είναι παράλληλες προς τον άξονα της έλικας. Η ομάδα C = O κάθε πεπτιδικού δεσμού συνδέεται στην ομάδα Ν-Η του πεπτιδικού δεσμού που σχηματίζει δεσμό υδρογόνου. Όλες οι ομάδες R υποδεικνύονται προς τα έξω από την έλικα.

Βελτιωμένο φύλλο βήτα: Κάθε πεπτιδικός δεσμός στο βήτα πτυχωτό φύλλο είναι επίπεδη και έχει τη διαμόρφωση. Οι ομάδες Ο-Ο και Ν-Η πεπτιδικών δεσμών από γειτονικές αλυσίδες βρίσκονται στο ίδιο επίπεδο και το ένα προς το άλλο σχηματίζουν δεσμό υδρογόνου μεταξύ τους. Όλες οι ομάδες R σε οποιαδήποτε αλυσίδα μπορούν εναλλακτικά να εμφανίζονται πάνω και κάτω από το επίπεδο του φύλλου.

Ορισμοί:

Δευτερεύουσα δομή: Είναι το σχήμα μιας αναδιπλούμενης πρωτεΐνης λόγω δεσμού υδρογόνου μεταξύ της αμιδικής βάσης και των καρβονυλικών ομάδων.

Αναφορές: "Δομή πρωτεϊνών". ChemWiki: Η Δυναμική Χημεία Υπερtext "Πρωτεϊνική Δευτερεύουσα Δομή: α-Ηλίκες και β-Φύλλα". Πρωτεϊνικές δομές. com από τον Salam Al Karadaghi "Οργανική Χημεία". Το Εικονικό Κυτταρικό Εγχειρίδιο "Φύλλο Beta". Wikipedia Η ευγένεια της εικόνας: "Helix electron density myoglobin 2nrl 17-32" Από τον / την Dcrjsr - Η δική του δουλειά (CC BY 3. 0) μέσω Wikimedia Wikimedia "Πρωτεϊνική δευτερογενής δομή" από τον χρήστη: Bikadi (CC BY-SA Commons Wikimedia "1gwe antipar beta Φύλλο αμφίδρομο" από Dcrjsr - Ίδια δουλειά (CC BY 3.0) μέσω Wikimedia Commons