Διαφορά μεταξύ γονιδιακής έκφρασης σε προκαρυώτες και ευκαρυώτες: έκφραση γονιδίου σε προκαρυώτες εναντίον ευκαρυωτικών γονιδίων
Έκφραση γονιδίων σε προκαρυώτες έναντι ευκαρυωτικών
Η γονιδιακή έκφραση είναι μια βασική διαδικασία που λαμβάνει χώρα τόσο στους προκαρυώτες όσο και στους ευκαρυώτες. Παρά το γεγονός ότι τα αποτελέσματα τόσο στους ευκαρυώτες όσο και στους προκαρυώτες είναι τα ίδια, υπάρχουν σημαντικές διαφορές μεταξύ τους. Η γενετική έκφραση συζητείται γενικά και οι διαφορές μεταξύ των προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών διεργασιών επισημαίνονται ειδικότερα σε αυτό το άρθρο.
-Έκφραση γονιδίων
Όταν η πληροφορία ενός γονιδίου μετατρέπεται σε δομικές μορφές, το συγκεκριμένο γονίδιο λέγεται ότι εκφράζεται. Η έκφραση γονιδίων είναι μια διαδικασία που κάνει βιολογικά σημαντικά μόρια, και αυτά είναι συνήθως μακρομόρια. Τα γονίδια εκφράζονται κυρίως με τη μορφή πρωτεϊνών, αλλά το RNA είναι επίσης προϊόν αυτής της διαδικασίας. Δεν θα μπορούσε να υπάρξει μορφή ζωής χωρίς να λάβει χώρα η διαδικασία έκφρασης γονιδίων.
Τρία κύρια βήματα υπάρχουν σε γονιδιακή έκφραση γνωστή ως μεταγραφή, επεξεργασία RNA και μετάφραση. Η τροποποίηση πρωτεΐνης μετα μεταφράσεων και η μη-κωδικεύουσα ωρίμανση RNA είναι μερικές από τις άλλες διαδικασίες που εμπλέκονται με γονιδιακή έκφραση. Στο στάδιο της μεταγραφής, η νουκλεοτιδική αλληλουχία του γονιδίου στον κλώνο DNA μεταγράφεται σε RNA μετά την αποδιάταξη του κλώνου ϋΝΑ με ένζυμο ελικάσης DNA. Ο νεοσυσταθείς κλώνος RNA (το mRNA) ανασχηματίζεται με απομάκρυνση των μη κωδικοποιητικών αλληλουχιών και λήψη της αλληλουχίας νουκλεοτιδίων του γονιδίου στα ριβοσώματα. Υπάρχουν συγκεκριμένα μόρια tRNA (μεταφορά RNA) που αναγνωρίζουν τα σχετικά αμινοξέα στο κυτταρόπλασμα. Μετά από αυτό, μόρια tRNA συνδέονται με τα συγκεκριμένα αμινοξέα. Σε κάθε μόριο tRNA, υπάρχει μια αλληλουχία τριών νουκλεοτιδίων. Ένα ριβόσωμα στο κυτταρόπλασμα συνδέεται με τον κλώνο mRNA και το κωδικόνιο έναρξης (ο υποκινητής) ταυτοποιείται. Τα μόρια tRNA με τα αντίστοιχα νουκλεοτίδια για την αλληλουχία mRNA μετακινούνται στη μεγάλη υπομονάδα του ριβοσώματος. Καθώς τα μόρια tRNA έρχονται στο ριβόσωμα, το αντίστοιχο αμινοξύ συνδέεται με το επόμενο αμινοξύ στην αλληλουχία μέσω πεπτιδικού δεσμού. Αυτή η σύνδεση πεπτιδίων συνεχίζεται μέχρις ότου το τελευταίο κωδικόνιο αναγνωστεί στο ριβόσωμα. Με βάση την αλληλουχία αμινοξέων στην πρωτεϊνική αλυσίδα, το σχήμα και η λειτουργία ποικίλλουν για κάθε μόριο πρωτεΐνης. Αυτό το σχήμα και η λειτουργία είναι αποτελέσματα της αλληλουχίας νουκλεοτιδίων στο μόριο ϋΝΑ.Ως εκ τούτου, γίνεται σαφές ότι διαφορετικά γονίδια κωδικοποιούν διαφορετικές πρωτεΐνες με μεταβλητά σχήματα και λειτουργίες.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ της έκφρασης γονιδίων σε προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά;
• Καθώς τα προκαρυωτικά δεν έχουν πυρηνικό περίβλημα, τα ριβοσώματα μπορούν να αρχίσουν να συνθέτουν την πρωτεΐνη καθώς σχηματίζεται ο κλώνος mRNA. Αυτό είναι πολύ αντίθετο με την ευκαρυωτική διαδικασία, όπου ο κλώνος mRNA πρέπει να μεταφερθεί στο κυτταρόπλασμα για να συνδεθούν τα ριβοσώματα με αυτό. Επιπλέον, ο αριθμός των κύριων βημάτων είναι δύο στην προκαρυωτική γονιδιακή έκφραση, ενώ υπάρχουν τρία βασικά βήματα στην ευκαρυωτική διαδικασία.
• Υπάρχουν αλληλουχίες ιντρονίου στο ευκαρυωτικό DNA έτσι ώστε ο κλώνος mRNA να έχει επίσης αυτές. Επομένως, η συναρμολόγηση RNA πρέπει να λάβει χώρα πριν από την οριστικοποίηση του κλώνου mRNA μέσα στον πυρήνα σε ευκαρυωτικά. Ωστόσο, δεν υπάρχει στάδιο επεξεργασίας RNA σε προκαρυώτες λόγω της έλλειψης ιντρονίων στο γενετικό τους υλικό.
• Υπάρχει η δυνατότητα ταυτόχρονης έκφρασης συστάδων γονιδίων (γνωστών ως οπερόνια) στην προκαρυωτική διαδικασία. Ωστόσο, μόνο ένας εκφράζεται ταυτόχρονα σε ευκαρυώτες, και ο επόμενος κλώνος mRNA αποικοδομείται μετά την έκφραση, επίσης.
