Διαφορά μεταξύ DNA πολυμεράσης και πολυμεράσης RNA
ενάντια σε RNA πολυμεράση
Πρόκειται για δύο διαφορετικά ένζυμα υπεύθυνα για διαφορετικές λειτουργίες που λαμβάνουν χώρα σε κυτταρικό επίπεδο. Πρωταρχικά ο σχηματισμός των κλώνων DNA και RNA ρυθμίζεται από αυτά τα ένζυμα. Αυτό το άρθρο σκοπεύει να συζητήσει τις κύριες διαφορές αυτών των εξαιρετικά σημαντικών ενζύμων για πολλές διαδικασίες διατήρησης της ζωής.
Πολυμεράση DNA
Το ένζυμο ϋΝΑ πολυμεράσης αρχίζει τη λειτουργία του κατά την αναπαραγωγή του DNA, στο στάδιο της διαμόρφωσης των σχετικών νουκλεοτιδίων για τον σχηματισμό δεσμών υδρογόνου μεταξύ των αντίστοιχων αζωτούχων βάσεων των υφιστάμενων και των νέων κλώνων ϋΝΑ. Αυτό το ένζυμο καθίσταται λειτουργικό αφού αποσυντεθεί η διπλασιασμένη δομή του διπλού έλικα DNA ή ξετυλίγεται από το ένζυμο εξωνουκλεάσης που ονομάζεται ελικάση DNA. Ο πολυμερισμός των δεοξυριβονουκλεοτιδίων αρχίζει πάντα από το 3 'άκρο του κλώνου ϋΝΑ. Υπάρχουν πολλοί τύποι ϋΝΑ πολυμεράσης και κάθε τύπος αποτελείται από πρωτεΐνη, πράγμα που σημαίνει ότι περιέχει μια αλληλουχία βάσεων μοναδικών για ένα συγκεκριμένο ένζυμο. Υπάρχουν περίπου 900-1000 αμινοξέα σε αλυσίδες ανθρώπινης ϋΝΑ πολυμεράσης. Συνήθως, κατά τη διάρκεια της διαδικασίας αντιγραφής, η ϋΝΑ πολυμεράση είναι ικανή να αντιγράψει την αλληλουχία των αζωτούχων βάσεων, έτσι ώστε να μπορεί να παράγει πιο όμοιους κλώνους από ένα ένζυμο. Η μεταβολή αυτού του ενζύμου σε διαφορετικά είδη δεν είναι πολύ έντονη, καθώς οι καταλυτικές υπομονάδες της ενζυμικής δομής είναι σχεδόν ίδιες σε πολλά είδη. Ωστόσο, βάσει αυτών των ελαφρών αλλαγών έχουν εντοπιστεί επτά οικογένειες ϋΝΑ πολυμεράσεων ονομαζόμενες ως Α, Β, C, D, Χ, Υ και RT. Όλοι αυτοί οι τύποι έχουν συλλογικά 15 διαφορετικά ένζυμα μεταξύ των ευκαρυωτικών και 5 μεταξύ των προκαρυωτικών.Η RNA πολυμεράση είναι το κύριο ένζυμο που καταλύει την παραγωγή των κλώνων RNA. Τα πρότυπα αλληλουχιών αζωτούχων βάσεων DNA βασίζονται συνήθως στην παραγωγή RNA και αυτό το ένζυμο είναι ικανό για πολλές λειτουργίες. Πρώτον, το συγκεκριμένο τμήμα του κλώνου DNA (συνήθως ένα γονίδιο) ξετυλίγεται μέσω θραύσης των δεσμών υδρογόνου μεταξύ των αντίστοιχων βάσεων των αντίθετων κλώνων με πολυμεράση RNA. Μετά από αυτό, η αντιγραφή της αλληλουχίας βάσης με αντικατάσταση ουρακίλης για θυμίνη λαμβάνει χώρα από το άκρο 3 'προς το 5' του κλώνου ϋΝΑ. Το σημείο εκκινήσεως του πολυμερισμού RNA του κλώνου ϋΝΑ ονομάζεται προωθητής ενώ το τέλος ολοκλήρωσης είναι γνωστό ως ο τερματιστής. Επειδή αυτό το ένζυμο σχηματίζει τον κλώνο χρησιμοποιώντας ριβονουκλεοτίδια, χρησιμοποιείται ο όρος RNA πολυμεράση για αναφορά. Η RNA πολυμεράση μπορεί να παράγει μια σειρά προϊόντων που περιλαμβάνουν αγγελιαφόρο RNA, ριβοσωμικό RNA, RNA μεταφοράς, μικρο RNA και ριβοένζυμο ή καταλυτικό RNA. Επειδή η πολυμεράση RNA είναι ικανή να ξετυλίγει τον κλώνο DNA, δεν χρειάζεται άλλο ένζυμο να αποσυναρμολογήσει τη δομή διπλής έλικας.Στα βακτήρια, η πολυμεράση του RNA είναι λίγες που χαρακτηρίζονται ως α2, β, β 'και ω. Αυτές οι βακτηριακές RNA πολυμεράσες διαφέρουν ελαφρώς από κάθε άλλη δομική και λειτουργική. Υπάρχουν μεταγραφικοί συμπαράγοντες που συνδέονται με την πολυμεράση RNA σε διαφορετικά σημεία για να ενισχύσουν τη λειτουργία, ειδικά σε ορισμένα βακτήρια όπως το Ε. Coli.