Διαφορά μεταξύ VNTR και STR | VNTR vs STR

Βασικές διαφορές - VNTR vs STR

Αρκετές τεχνικές που σχετίζονται με ανάλυση DNA χρησιμοποιούνται για την ταυτοποίηση ενός συγκεκριμένου γονιδίου ή μιας αλληλουχίας ϋΝΑ σε μια ομάδα άγνωστου ϋΝΑ. Είναι γνωστοί ως γενετικοί δείκτες. Γενετικοί δείκτες χρησιμοποιούνται στη μοριακή βιολογία για τον εντοπισμό των γενετικών παραλλαγών μεταξύ ατόμων και ειδών. Η διαδοχική επαναλαμβανόμενη αλληλουχία (VNTR) και η σύντομη διαδοχική επανάληψη (STR) είναι δύο τύποι γενετικών δεικτών που εμφανίζουν πολυμορφισμό μεταξύ των ατόμων. Και οι δύο τύποι είναι μη κωδικοποιητικό επαναλαμβανόμενο DNA που είναι αλληλοδιαδόχες επαναλήψεις. Είναι διατεταγμένα σε μια μόδα από το κεφάλι μέχρι την ουρά στα χρωμοσώματα. Το VNTR είναι ένα τμήμα του γονιδιώματος όπου η βραχεία αλληλουχία νουκλεοτιδίων επαναλαμβάνεται αρκετές φορές. Το STR είναι ένα άλλο τμήμα του DNA εντός του γονιδιώματος το οποίο οργανώνεται ως επαναλαμβανόμενες μονάδες αποτελούμενες από δύο έως δεκατρία νουκλεοτίδια εκατό φορές. Η βασική διαφορά μεταξύ του VNTR και του STR είναι ο αριθμός των νουκλεοτιδίων σε μια επαναλαμβανόμενη αλληλουχία. Οι μονάδες επανάληψης του VNTR αποτελούνται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια ενώ η επαναλαμβανόμενη μονάδα του STR αποτελείται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια . Τα VNTR και STR χρησιμοποιούνται ευρέως σε ιατροδικαστικές μελέτες.

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ

1. Επισκόπηση και διαφορά κλειδιού

2. Τι είναι το VNTR

3. Τι είναι το STR

4. Ομοιότητες μεταξύ VNTR και STR

5. Σύγκριση μεταξύ τους - VNTR vs STR σε πινακοειδή φόρμα

6. Περίληψη

Τι είναι το VNTR;

Μια επαναλαμβανόμενη αλληλουχία είναι μια σύντομη ακολουθία DNA που επαναλαμβάνεται από μόλυβδο σε ουρά σε συγκεκριμένο χρωμοσωμικό τόπο. Δεν υπάρχει άλλη αλληλουχία ή νουκλεοτίδιο μέσα στην επαναλαμβανόμενη αλληλουχία. Υπάρχουν αρκετοί τύποι επαναλαμβανόμενων αλληλουχιών στο γονιδίωμα. Το VNTR είναι ένας τύπος επαναλαμβανόμενης αλληλουχίας μεταξύ τους που έχει επαναλαμβανόμενες μονάδες αποτελούμενες από 10 έως 100 νουκλεοτίδια. Το VNTR είναι ένας τύπος minisatellite. Αυτές οι διαδοχικές επαναλήψεις μπορούν να βρεθούν σε πολλά χρωμοσώματα. Είναι διασκορπισμένα μέσα στο ανθρώπινο γονιδίωμα και βρίσκονται κυρίως στις υποτελικές περιοχές των χρωμοσωμάτων.

Οι VNTR εμφανίζουν πολυμορφισμό διαδοχικών επαναλήψεων μεταξύ των ατόμων. Το μήκος του VNTR σε μια συγκεκριμένη θέση του χρωμοσώματος είναι πολύ μεταβλητό μεταξύ των ατόμων λόγω της μεταβολής του αριθμού των επαναλαμβανόμενων μονάδων που οργανώνονται σε αυτό το τμήμα του DNA. Ως εκ τούτου, το VNTR μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως ισχυρό εργαλείο για την ταυτοποίηση των ατόμων και η ανάλυση VNTR χρησιμοποιείται σε πολλούς τομείς, όπως η γενετική, η βιολογική έρευνα, η εγκληματολογία και η εκτύπωση δακτυλικών αποτυπωμάτων DNA.Τα VNTRs ήταν οι πρώτοι γενετικοί δείκτες που χρησιμοποιήθηκαν για την ποσοτικοποίηση της μεταμόσχευσης μοσχεύματος μυελού των οστών. Οι VNTRs ήταν επίσης οι πρώτοι πολυμορφικοί δείκτες που χρησιμοποιήθηκαν για τη διαμόρφωση του προφίλ DNA σε ιατροδικαστικά.

Εικόνα 01: Μεταβολή των VNTRs σε έξι άτομα

Η ανάλυση VNTR πραγματοποιείται μέσω πολυμορφισμού μήκους θραυσμάτων περιορισμού ακολουθούμενης από υβριδισμό νότου. Ως εκ τούτου, χρειάζεται συγκριτικά ένα μεγάλο δείγμα DNA. Η ερμηνεία του προφίλ VNTR είναι επίσης προβληματική. Λόγω αυτών των περιορισμών, η χρήση του VNTR στην εγκληματολογική γενετική έχει περιοριστεί και αντικαθίσταται από την ανάλυση STR.

Τι είναι το STR;

Το STR είναι ένα εξαιρετικά επαναλαμβανόμενο τμήμα DNA που αποτελείται από δύο έως δεκατρείς επαναλαμβανόμενες μονάδες νουκλεοτιδίων που διοργανώνονται με διαδοχικό τρόπο. Το STR είναι παρόμοιο με το VNTR. Αλλά ποικίλει από το VNTR από τον αριθμό των νουκλεοτιδίων σε μια επαναλαμβανόμενη ακολουθία και από τον αριθμό των επαναλήψεων. Ο STR είναι ένας τύπος μικροδορυφόρου.

Η ανάλυση STR ενέχει τη μέτρηση του ακριβούς αριθμού επαναλαμβανόμενων μονάδων. Οι STR είναι πολύ μεταβλητές μεταξύ των ατόμων, παρόμοιες με τις VNT. Τα προφίλ STR διαφέρουν από άτομο σε άτομο. Επομένως, η ανάλυση STR χρησιμοποιείται στη μοριακή βιολογία για να συγκρίνει συγκεκριμένους τόπους στο DNA από δύο ή περισσότερα δείγματα. Ως εκ τούτου, οι STRs θεωρούνται ισχυροί γενετικοί δείκτες στη μοριακή βιολογία. Παρέχει ένα εξαιρετικό εργαλείο για την ταυτοποίηση των ατόμων λόγω του υψηλού βαθμού πολυμορφισμού τους και σχετικά μικρού μήκους.

Επί του παρόντος, οι STRs είναι το πιο συχνά χρησιμοποιούμενο αναλυτικό εργαλείο γενετικού πολυμορφισμού στην εγκληματολογική γενετική. Οι περισσότερες εγκληματολογικές υποθέσεις συνεπάγονται πολυμορφική ανάλυση STR. Οι STR loci κατανέμονται σε όλο το γονιδίωμα. Υπάρχουν χιλιάδες STR που βρίσκονται σε χρωμοσώματα τα οποία μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην ιατροδικαστική ανάλυση. Η ανάλυση STR δεν περιλαμβάνει πολυμορφισμό μήκους περιορισμού όπως ανάλυση VNTR. Η ανάλυση STR δεν κόβει το ϋΝΑ με ένζυμα περιορισμού. Χρησιμοποιούνται ειδικοί ανιχνευτές για την προσάρτηση επιθυμητών περιοχών στο DNA και χρησιμοποιώντας τεχνική PCR, προσδιορίζονται τα μήκη του STR.

Εικόνα 02: Μεταβολή STR μεταξύ δειγμάτων

Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ του VNTR και του STR;

Το VNTR και το STR είναι μη κωδικοποιημένο DNA.

Και οι δύο επαναλήψεις.
Και οι δύο παρουσιάζουν πολυμορφισμό μεταξύ των ατόμων λόγω της διαφοράς στο μήκος του τμήματος DNA.
Και οι δύο χρησιμοποιούνται ως ισχυροί γενετικοί δείκτες στην εκτύπωση δακτυλικών αποτυπωμάτων DNA και σε ιατροδικαστικές μελέτες.
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ VNTR και STR;

- diff Άρθρο Μέσος πριν από τον Πίνακα ->

VNTR vs STR

Το VNTR είναι ένα μη κωδικοποιητικό επαναλαμβανόμενο DNA το οποίο έχει μια σύντομη ακολουθία νουκλεοτιδίων που επαναλαμβάνεται διαδοχικά.
Το STR είναι ένα εξαιρετικά επαναλαμβανόμενο τμήμα DNA που αποτελείται από δύο έως δεκατρείς επαναλαμβανόμενες μονάδες νουκλεοτιδίων που διοργανώνονται με διαδοχικό τρόπο.	Μέγεθος
Τα VNTRs είναι μεγαλύτερα από τα STRs.
Οι STR είναι μικρότερες από τις VNTR.	Αριθμός νουκλεοτιδίων στην ακολουθία επανάληψης
Η επαναλαμβανόμενη μονάδα του VNTR αποτελείται από 10 έως 100 νουκλεοτίδια.
Η επαναλαμβανόμενη μονάδα του STR αποτελείται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια.	Περίληψη - VNTR vs STR

Το VNTR και το STR είναι δύο ισχυροί γενετικοί δείκτες που χρησιμοποιούνται στη μοριακή βιολογία, ειδικά στον τομέα της εγκληματολογικής γενετικής.Το VNTR είναι ένας τύπος minisatellite και ο STR είναι ένας μικροδορυφόρος. Το VNTR και το STR είναι μη κωδικοποιημένο, πολύ επαναλαμβανόμενο DNA. Είναι επαναλαμβανόμενες διδασκαλίες. Η γενική δομή των VNTR και STR είναι η ίδια. Ωστόσο, ο αριθμός των νουκλεοτιδίων στην επαναλαμβανόμενη αλληλουχία και το μήκος είναι διαφορετικοί. Το VNTR έχει επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες αποτελούμενες από 10 έως 100 νουκλεοτίδια. Το STR έχει επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες που αποτελούνται από 2 έως 13 νουκλεοτίδια. Αυτή είναι η διαφορά μεταξύ VNTR και STR.

Κατεβάστε την έκδοση PDF του VNTR vs STR

Μπορείτε να κατεβάσετε την έκδοση PDF αυτού του άρθρου και να το χρησιμοποιήσετε για σκοπούς εκτός σύνδεσης σύμφωνα με τις σημειώσεις παραπομπής. Παρακαλούμε κάντε λήψη της έκδοσης PDF εδώ Διαφορά μεταξύ VNTR και STR.

Αναφορές:

1. "Η επιστήμη της ιατροδικαστικής γενετικής. "CRG - Συμβούλιο για την υπεύθυνη γενετική. Ν. Ρ., n. ρε. Ιστός. Διατίθεται εδώ. 10 Ιουλίου 2017.

2. "Ανάλυση STR. "Wikipedia. Ίδρυμα Wikimedia, 22 Μαρτίου 2017. Ιστός. Διατίθεται εδώ. 10 Ιουλίου 2017.

Ευγένεια εικόνας: